Der Standard Befehl ist:
mysqlcheck -uroot -p<root -password> --auto-repair --check --optimize --all-databases
Unter Plesk sieht das ganze dann so aus:
mysqlcheck -uadmin -p`cat /etc/psa/.psa.shadow` --auto-repair --check --optimize --all-databases
Also simpel und einfach, auch in der erweiterten Form.
Denn hier wird der normale Mysql Root Parameter genutzt.